[ 2021/12/01 追記 ]
本記事は2018年4月時点の記事ですが、現在はユーザーがコミュニティ（旧グループ）作成をできなくする設定は可能です。以下の記事を参照してください。
Yammer ：ユーザーがコミュニティ作成をできなくする設定
そもそも Microsoft Teams や Yammer のようなアプリは、その性質上、チームやグループはユーザーに自由に作成してもらうべきで、それを制限や禁止する事はそのメリットを半減させるどころか、その前に利用されなくゴーストタウン化すると思います。これらのアプリを導入する際には、極力制限やガイドラインは少なくすべきかなと思います。
とはいえ、特に日本においては機能を制限させる事についての問い合わせが他国に比べて多いようです。（先日の Office 365 勉強会の中で中の人が嘆いていました。）非常に残念ですね。だからこそ導入に失敗しやすいんでしょうね。とはいえ、それぞれ事情があるので…。
で、 Microsoft Teams では Office 365 グループの作成を制限する事でチームの作成を制限する事ができますが、それでは Yammer のグループはどうなんでしょうか？また、Yammer も Office 365 グループと統合できますが、その場合、 Teams と同様に Office 365 グループの作成を制限する事で Yammer のグループの作成を制限する事ができるのでしょうか？
まず、Yammer の管理画面を隅々まで探したのですが、そのような設定項目はありませんでした。
思えば過去に Yammer 導入プロジェクトに関わった頃に、グループ作成を制限できないので、週1でグループ作成されていないか監視して作られていたら作成者に注意…なんて事やっていたのを思い出しました。あれから5年くらいは経過したと思いますが、そのような機能は実装されていないようです。（ちなみに上述のプロジェクトでは Yammer の導入は失敗しています。そりゃそうだ！という原因は色々ありました。）
裏を取るためにお得意の Office 365 のサポートから問い合わせてみました。
■グループ作成機能の制限はできない
グループの作成を制限する事は Yammer のコンセプトに反するのでそのような機能はないとの事です。ごもっともです！
ただ、ネットワーク外のユーザーも参加できる「外部グループ」に関しては、作成機能を無効化する事は可能なようです。
■ Office 365 グループと統合をしても Yammer のグループ作成を制限できない
Office 365 グループと統合すると Teams のチームのように作成制限できる可能性は？という質問に対しては、Yammer グループを作成した時に Office 365 グループが作成されないようにはなるけど、Yammer グループは作成されるという事です。
つまり、グループ作成を禁止したり、IT部門への申請制にしたいニーズが必須であった場合は、 Yammer は導入検討から外した方が良さそうです。
たいていのグループ作成を制限したり禁止したい理由は「雑談されて生産性が落ちるのでは？」「陰口用のグループが横行するのでは？」「炎上など余計な運用やトラブルが増える」などあります。
しかしよく考えてみてください。 Yammer を導入したからってそれらのトラブルやリスクが増える可能性は低いでしょう。むしろトラブルやリスクが見える化されて良いのではないでしょうか。（議論し解決できる機会ができます。）サボる人は何してもサボります。 Yammer を導入したから生産性が落ちるわけではなく、それは別の問題だと思います。 Yammer 禁止にしてもタバコ部屋や休憩所でサボるだろうしトイレの個室の中で居眠りするでしょう。陰口や無駄口を懸念するということはおそらくメールという手段で今だってあるのでは？それも問題点は陰口が横行する雰囲気をどう改善するか？であって Yammer ではないはず。炎上だってコミュニケーション手段がたまたま Yammer に変わっただけで、炎上する火種が実は元々あったわけで、火種が見える事は場合によってはかえって良い事なのでは？
導入しようとしたキッカケやメリットに立ち返った際に、それらの可能性を様々な機能制限やガチガチのガイドラインで殺してしまうのは非常にもったいないです。そしてユーザーはメリットを実感できなく、おそらく導入に失敗するでしょう。
いたって僕の個人的意見としては、 Yammer は福利厚生の一環として、社内の部活動のコミュニケーションツールにしたり、婚活用に役立てたり、英語勉強用グループを作ったり、社内勉強会や技術交流の場にしたり、そんな使い方も十分良いのではと思ったりします。従業員満足度が高まった上で Yammer 上のコミュニケーションが増えるほど、組織の壁を越えたコミュニケーションから新たな組織の可能性が出てくる可能性も高まります。あくまでも希望的観測の個人的な意見ですが。